Zwergdommeln brauchen zum Leben unbedingt Wasser und Schilf.
Der Lebensraum muss zwar nicht besonders groß sein, dafür ist es aber wichtig, dass sie sich zwischen den Schilfhalmen gut verstecken können. In Südeuropa leben sie sogar an Bewässerungs-Gräben, die mit Schilf bewachsen sind.
Ansonsten bevorzugen sie ruhige Seen, ruhige Flüsse oder Kiesgruben.